L’organisation actuelle se présente comme suit (voir organigramme ci dessous) :
- Une Direction Générale (Siège) avec quatre (04) Directions Fonctionnelles Centrales.
- Onze Unités Aéroportuaires Opérationnelles .
Le niveau de classification de chaque Unité Opérationnelle est défini par l’importance du trafic généré par chaque Unité à savoir :
- Niveau 1 : Aéroport d’Oran.
- Niveau 2 : Aéroport de Tlemcen.
- Niveau 3 : Aéroport d’Adrar, Béchar et Tindouf.
- Niveau 4 : Aéroport de Timimoun et Tiaret et El Bayadh.
- Niveau 5 : Aéroport de Mécheria, Bordj Baji Mokhtar et Mascara.